新冠病毒变化多端,基因测序怎么跟节奏

  新冠病毒千变万化,基因测序怎么跟节奏
  世卫组织公布科学应对指南

  国际战“疫”行动

  ◎实习记者 张佳欣

  在受到大规模全球紧急情况的挑战时,若何科学有用应对是全球面临的配合现实。新冠肺炎大盛行为科学开启了伟大的时机,并让科学在这之中充分施展了作用。其中,以闪电般的速率开发疫苗就是核心手艺能力的体现,基因组测序亦然。

  1月11日,世界卫生组织举行新冠肺炎例行公布会,总干事谭德塞示意,病毒流传得越广,变异的可能性就会增添。最要害的是,我们可以有用地对病毒举行测序,从而领会病毒是若何转变的以及我们该若何应对。虽然诊断工具和疫苗对当前的病毒仍然有用,但未来我们有可能需要举行调整。

  上周,世卫组织公布了一项周全的实行指南和风险监测框架,以辅助各国确立具有影响力的基因测序方案。

  基因测序利于追踪病毒和疫情防控

  这份针对基因测试实行的指南称,新冠病毒基因测序可以用于许多差别的领域,包罗改善诊断、制订对策和疾病盛行病学观察。

  疫情暴发早期,新冠病毒基因组序列的共享使分子诊断剖析得以迅速生长,这提高了全球针对疫情的防止能力,并有助于各国制订对策。快速、大规模的病毒基因组测序有助于明白病毒盛行的动态和评估防控措施的有用性。

  现在,科学的生长已经允许我们在病例确诊后数小时或数天内对新冠病毒举行测序。实时基因组测序能够为公共卫生部门对大盛行的反映提供信息。

  越来越多的人认识到病毒基因组测序有助于促进民众康健。因此,也有更多国家的实验室在这一领域举行投资。然而,指南示意,基因测序涉及的成本和事情量是伟大的,各国实验室需要对这项投资的预期公共卫生回报有一个清晰的想法。

  指南还警示称,只管基因测序有“把关人”的存在,但主要的是,那些制订目的、举行基因组剖析和使用效果数据的人要意识到基因测序受某些气力主导而存在的局限性,以及潜在的私见泉源。

“你好,世界”被成功编码 CRISPR技术将数据存入活细胞DNA

美国哥伦比亚大学研究团队使用CRISPR基因编辑技术,将编码二进制数据(计算机用来存储数据的1和0)的特定DNA序列插入细菌细胞。将具有高比例触发序列的延伸片段表示为二进制“1”,缺少这些序列则记为“0”,由此可将数字信息直接编码到细菌的基因组中。

  基因测序实行需周密思量和详细设计

  这份指南对各国若何实行基因测序给出了详细指导。指南称,在最先基因测序设计之前,主要的是要清楚地领会测序的目的、剖析战略和若何行使研究效果为公共卫生反映提供信息的设计。新冠肺炎大盛行的每个阶段都市提出对公共卫生至关主要的差别挑战,要想应对其中某些挑战,需要我们接纳差别的基因组采样计谋。

  关于实行基因测序的相关注意事项,指南称,基因测序目的的决议应该在包罗所有利益相关者的高级代表的多学科框架内做出。同时,为确保可连续的支持,应确定测序所需资金泉源,包罗专家职员、测序装备和消耗品的成本,以及处置和存储数据所需的盘算架构。实验室也应仔细评估是否存在伦理方面的问题。此外,实验室还应对其选定方案中的每一步骤举行生物平安风险评估。

  在基因测序的目的方面,实验室应说明有关用于基因测序和样本选择方式的手艺思量。当前,有几种装备可用于新冠病毒基因组测序。由于每次读取数据的准确性、发生的数据量和周转时间的差别,每种装备在特定情况下或许都有一定的适用性。

  为实现基因测序目的,大多数情况下,病毒序列数据和样本元数据都是必须的。获取此类数据并将其转换为准确的剖析花样可能需要大量资源,然则也有助于最大限度地施展测序的潜在影响。

  此外,指南还提到,基因样本在运输、存储、检测中若何保留完整性、对数据效果若何科学剖析和注释以制止误解都是需要思量的。

  指南还示意,无论发生若干新冠病毒基因组序列,只有为随后发生和流传有用和实时的效果制订战略,它们才会对公共卫生发生积极影响。

  基因测序网络离不开全球共享与互补互助

  “若是我们想要更好地为未来的威胁做好准备,就必须将基因组测序加速整合到全球卫生界的实践中。”世卫组织盛行症危害管理部门主管西尔维·布莱恩德在这份指南的前言中称,“我们希望这一指导将有助于为准备事情铺平道路。”

  指南示意,许多剖析依赖于将内陆获得的病毒序列与全球病毒基因组多样性举行对照的能力。因此,适当地共享病毒基因组序列是至关主要的,例如在GISAID和GenBank等资料库中,全球共享数据正在举行时。

  指南激励各国加大互补互助,以确保最大限度地施展现有能力。例如,一些国家可能需要提高建设响应实验室的能力,而另一些国家可能决议将现实基因测序事情外包,并将重点放在生物信息学、数据管理和数据注释上。

  “确立一个强大和有弹性的全球基因测序网络可以最大限度地提高测序对民众康健的影响,不仅对新冠病毒,对未来泛起的病原体也是云云。”指南中写道。

  在11日的例行公布会上,谭德塞也示意,世卫组织呼吁所有国家增添对新冠病毒的基因测序并在全球范围内共享这些数据,以弥补正在举行的监控、检查和检测事情。

  病毒无国界,它是我们全人类面临的配合挑战。世界各国是运气配合体,无人能置身其外,独善其身,只有联合起来,才气战胜难题。

【编辑:卞立群】

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